本发明公开了一种新型脂肪酶基因和脂肪酶生产菌株及应用，属于酶法脱墨领域。新型脂肪酶基因经过密码子优化得到，该脂肪酶基因在毕赤酵母中可实现高表达。将该基因连接到毕赤酵母表达质粒pPICZα中得到质粒pPICZαA-ARL，再将质粒pPICZαA-ARL转化毕赤酵母宿主菌Pichia Pastoris X33得到脂肪酶生产菌株Pichia Pastoris X33pPICZαA-ARL。该菌株能高效表达脂肪酶，所表达的脂肪酶活力为2500UmL，具有耐中高温、耐碱性质，可有效应用于废旧报纸脱墨。
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