本发明提供一种高F值复合低聚肽的制备方法，采用氨基酸比例平衡及脂肪酸平衡的混合油料，进行粉碎、挤压膨化预处理后，选择两步酶解法，提取油脂与低聚肽混合液，借助活性炭的吸附作用，再经透析、超滤、冷冻干燥得到高F值的低聚肽。采用混合油料，有利于得到一种氨基酸比例平衡的低聚肽；酶法的应用，不仅减少了溶剂的使用，降低了环境污染及废水处理的能耗，而且保证了所提取的混合油料低聚肽的绿色制取，按照人类所需来剪切蛋白质得到具有高营养价值的天然植物低聚肽。
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